Dalla rivoluzione Darwiniana in poi il rapporto organismo-ambiente è stato messo al centro della riflessione teorica sul vivente. Organismo è riferito tanto ad ogni singolo individuo che interagisce con il suo ambiente in modi peculiari, quanto alla specie oppure al genotipo. L’Ecologia Evolutiva, la Genetica Ecologica sono specializzazioni recenti della Biologia originate da questa nuova attenzione. La maggiore comprensione di come sono, come funzionano, come evolvono gli organismi o gli ecosistemi deriva dalla possibilità di ricostruire i processi e le relazioni che li legano più che dalla sola descrizione di questi separatamente.